Misión
Vigilar que los aspectos financieros, operacionales y administrativos cumplan con los objetivos planteados en los programas de trabajo de cada una de las dependencias del Ayuntamiento, así como que cumplan con las disposiciones legales vigentes que enmarcan sus responsabilidades, funciones y actividades.
Visión
Que la Contraloría Municipal de San Pedro Cholula cumpla con las normas, disposiciones legales y las actividades para las que fue creada, en el marco de sus atribuciones y sea un referente dentro del ámbito Municipal.
En la época prehispánica Cholula era considerada un centro cultural y religioso tan importante como lo sería en la actualidad Chalma, Juquila o la Basílica de Guadalupe. Los Dioses que se veneraban eran Quetzatcoatl “Dios de los comerciantes y mercaderes” y Chiconauhquiauhitl “Dios de las nueve lluvias; el cual sustituyeron los frailes franciscanos por la Virgen de los Remedios quedando la fecha de celebración de fiesta en honor a ambos el mismo día, es decir el 8 de septiembre. Para tal efecto se acostumbraba que los pueblos llegaran desde lejos y gracias a la importancia de dichos Dioses era necesario que por lo menos una vez en su vida visitaran el lugar.